Main Article Content

Abstract

Genetik menjadi kunci konservasi karena berperan penting dalam  mempertahankan dan memulihkan populasi dari kerusakan. Kerusakan pada ekosistem terumbu karang dapat menjadi pemicu kepunahan organisme laut. Salah satu organisme yang tidak terhindar dari kerusakan tersebut ialah Sarcophyton trocheliophorum. Kerusakan tersebut dapat menyebabkan menurunnya keragaman genetik S. trocheliophorum. Tujuan dari penelitian ini adalah menganalisis keanekaragaman genetik dari S. trocheliophorum yang terdapat pada tiga populasi di Perairan Jawa, Sulawesi dan Nusa Tenggara serta mendeskripsikan implikasinya terhadap kawasan konservasi  di Indonesia. Penelitian ini menggunakan penanda genetik ND2 untuk menganalisis struktur populasi, konektivitas, dan keragaman genetik. Keragaman genetik S. trocheliophorum pada Perairan Jawa, Sulawesi, Nusa Tenggara masing-masing 0.600, 0.815, dan 0.972. Keragaman genetik pada populasi Perairan Jawa lebih kecil dibandingkan pada Populasi Perairan Sulawesi dan Nusa Tenggara. Hal ini dimungkinkan karena banyaknya aktivitas manusia pada pesisir utara Laut Jawa, sehingga berdampak pada menurunnya ukuran populasi S. trocheliophorum. Oleh karena itu perlu adanya perlindungan yang ketat pada populasi Jawa untuk menjaga kelestarian keanekaragaman hayati Indonesia.

Article Details

How to Cite
Kusuma, A. B., Bengen, D. G., Madduppa, H., Subhan, B., & Arafat, D. (2016). KEANEKARAGAMAN GENETIK KARANG LUNAK Sarcophyton trocheliophorum PADA POPULASI LAUT JAWA. NUSA TENGGARA DAN SULAWESI. JURNAL ENGGANO, 1(1), 89–96. https://doi.org/10.31186/jenggano.1.1.89-96

References

  1. Ambariyanto. 2010. Kebijakan pengelolaan organisme laut dilindungi: kasus Kerang Raksasa. Pidato pengukuhan Guru Besar Ilmu Kelautan pada
  2. Fakultas Perikanan dan Ilmu Kelautan, UNDIP.
  3. Bandelt, H.J, P. Forster & A. Röhl. 1999. Median-joining networks for inferring intraspecific phylogenies. Mol Biol Evol, 16: 37-48.
  4. Benayahu, Y & Y. Loya. 1986. Sexual reproduction of a soft coral: Synchronous and brief annual spawning of Sarcophyton glaucum (Quoy & Gairmard. 1833). Biol. Bull., 170: 32-42.
  5. Benayahu, Y. 1985. Faunistic compotition and pattern in the distribution of
  6. softcoral (Octocorallia Alcyonacea) along the coral reefs of Sinai Peninsula. Proc. 5th Int. Coral Reef Symp. Tahiti, 6:255-260.
  7. Bengen, D.G. 2002. Sinopsis ekosistem sumberdaya alam pesisir dan laut serta prinsip pengelolaannya. Bogor. Pusat Kajian Sumberdaya Pesisir dan
  8. Lautan. Institut Pertanian Bogor. 66 hal
  9. Botsford, L.W, J.W. White, M.A. Coffroth, C.B. Paris, S. Planes, T.L. Shearer, S.R. Thorrold, & G.P. Jones. 2009. Connectivity and resilience of coral reef metapopulations in marine protected areas: matching empirical efforts to predictive needs. Coral Reefs, 28: 327–337. EISSN: 2527-5186
  10. Excoffier, L & H. Lischer. 2009. Arlequin ver 3.5 User Manual; An Integrated Software Package For Population Genetics Data Analysis. Swiss
  11. Institute of Bioinformatics. Switzerland. 174 pp
  12. Exoffier, L, P.E. Smouse & J.M. Quattro. 1992. Analysis of moleculer variance inferred from metric distance among DNA haplotypes; application to human mitochondrial DNA restriction data. Genetics, 131 : 479-491.
  13. Fabricus, K & A. Philips. 2001. Softcoral and Sea fans. Australia. Australia
  14. Institute Of Marine Science.
  15. Gordon, A.L & R.A Fine. 1996. Pathways of water between the Pacific and Indian Oceans in the Indonesian seas. Nature, 379 : 146-149.
  16. Green, E.R & F. Shirley. 1999. The Global Trade in Coral. World Conservation Monitoring Centre. World Conservation Press, Cambridge, UK.60 pp.
  17. Hellberg, M.E, R.S. Burton, J.E. Neigel & S.R. Palumbi. 2002. Genetic
  18. assessment of connectivity among marine population. Bulletin of Marine
  19. Science, 70(1): 273–290.
  20. Hoegh-Guldberg, O. 2011. Coral reef ecosystems and anthropogenic climate change. Reg Environ Change, 11: 215–227.
  21. Jackson, J.B.C. 1986. Modes of dispersal of clonal benthic invertebrates:
  22. consequences for species’ distribution sand genetic structure of local
  23. populations. Bull Mar Sci., 32: 588?606.
  24. Kementerian Lingkungan Hidup. 2011. Laporan Indeks Kualitas Lingkungan
  25. Hidup Indonesia. 1-70 pp
  26. Lynch, M & T.J. Crease. 1990. The analysis of population survey data on DNA sequence variation. Moleculer Biology Evolution, 7: 337–394.
  27. Manuputty, A.E.W. 2002. Karang lunak (soft coral) Perairan Indonesia dalam: Buku I, Laut Jawa & Selat Sunda. Pusat Penelitian Oseanografi. LIPI. Jakarta. 91 hlm
  28. Manuputty, A.E.W. 1996. Pengenalan beberapa karang lunak (Octocorallia,
  29. Alcyonacea) di lapangan. Oseana, 21(4): 1-11.
  30. McFadden, C.S, P. Alderslade, L.P. van Ofwegen, H. Johnsen & A.
  31. Rusmevichientong. 2006. Phylogenetic relationships within the tropical
  32. soft coral genera Sarcophyton and Lobophytum (Anthozoa, Octocorallia). Invertebrate Biology, 125(4):288–305.
  33. Munday, P.L, J.M. Leis, J.M. Lough, C.B. Paris, M.J. Kingsford, M.L. Berumen & J. Lambrechts. 2009. Climate change and coral reef connectivity. Coral
  34. Reefs, 28: 379–395.
  35. Nei, M. 1972. Genetic distance between population. American Nature, 106: 283- 292.
  36. Nei, M. 1978. Estimation of average heterozygosity and geneti distance from a small number of individuals. Genetics, 89: 583-590.
  37. Nei, M. 1987. Moleculer Evolutionary Genetics. New York. Columbia University. Press. New York. 512 pp
  38. Nuryanto, A & M. Kochzius. 2009. Highly restricted gene flow and deep
  39. evolutionary lineages in the giant clam Tridacna maxima. Coral Reefs,
  40. : 607–619.
  41. Perwati, L.K. 2009. Analisis derajat ploidi dan pengaruhnya terhadap variasi ukuran stomata dan spora pada Adiantum raddianum. Bioma, 11(2): 39-44.
  42. Rozas, J, B.J.C. Sanchez-DeI, Messeguer & X.R. Rozas. 2003. DnaSP, DNA
  43. polymorphism analyses by the coalescent and other methods. Bioinformatics, 19: 2496–2497.
  44. Sachoemar, S.I & H.D. Wahjono. 2007. Pencemaran lingkungan perairan di
  45. Teluk Jakarta. JAI., 3(1): 1-14. EISSN: 2527-5186
  46. Sa´nchez, J.A, C.S. McFadden, S.C. France & H.R. Lasker HR. 2003. Molecular phylogenetic analyses of shallow-water Caribbean octocorals. Mar. Biol. 142: 975–987.
  47. Spalding, M.D, C. Ravilious, E.P Green. 2001. World atlas of coral reefs. UNEP World Conservation Monitoring Centre, University of California Press,
  48. Berkeley. 424 pp
  49. Strychar, K.B, T.M. Coates, P.W. Sammarco, T.J. Piva & P.T. Scott. 2005. Loss of Symbiodinium from bleached soft corals Sarcophyton ehrenbergi,
  50. Sinularia sp. and Xenia sp. Journal of Experimental Marine Biology and
  51. Ecology, 320: 159–177.
  52. Tamura K, Peterson D, Peterson N, Stecher G, Nei M, Kumar S. 2011. MEGA5: Molecular evolutionary genetics analysis using maximum likehood,
  53. evolutionary distance and maximum parsimony method. Moleculer
  54. Biology Evolution, 28(10): 2731-2739.
  55. Valtuena, F.J, J. Lopez, A.O. Olivencia, T.R. Riano & M. Gonzales. 2014.
  56. Contrasting inbreeding depression in early and late stages of the life
  57. cycle of a Mediterranean shrub, Anagyris foetida (Leguminosae). Turkish Journal of Botany, 38: 334-346
  58. Wijayanti, D.P, E. Indrayanti & C.A. Suryono. 2009. Kajian Konektivitas Genetik Antar Terumbu Sebagai Dasar Perencanaan Kawasan Restorasi
  59. Karang Dalam Upaya Menghadapi Global Warming. Semarang:Universitas Diponegoro. 30 pp
  60. Wilkinson, C. 2002. Status of coral reefs of the world:2002. Australian Institute of Marine Science. 363 pp