Article Sidebar

Submitted
April 22, 2021
Accepted
April 22, 2021
Published
April 29, 2021
Download
PDF
Statistic
Read Counter : 500 Download : 1817

Main Article Content

Abstract

Gambir merupakan salah satu tanaman yang mengandung katekin.Kandungan katekin pada gambir merupakan komponen yang menjadi syarat utama dalam penentuan mutu gambir. CHS (Chalcone synthase) adalah salah satu gen yang terlibat di dalam proses biosintesis pembentukan katekin. Penelitian ini bertujuan untuk mendapatkan primer yang dapat digunakan dalam deteksi gen CHS (Chalcone synthase) pada tanaman gambir tipe riau gadang serta untuk melihat kemampuan primer yang telah didesain untuk mendeteksi gen CHS pada tanaman gambir. Pendesainan primer dilakukan dengan mengalignment 21 data sekuengen CHS dan dipilih daerah yang memiliki kesamaan basa antara sekuen gen yang dialignment untuk mendapatkan primer.  Isolasi DNA gen CHS tanaman gambir menggunakan metode CTAB dan untuk isolasi RNA menggunakan Total RNA Mini Kit (Plant) dari Geneaid. Sintesis cDNA menggunakan kit Rever Tra Ace® qPCR RT Master Mix with gDNA Remover (Toyobo).Pada hasil desain primer didapatkan empat primer forward dan satu primer reverse. Hasil desain primer yang dapat digunakan untuk deteksi gen CHS dengan hasil cDNA tanaman gambir yaitu primer F3-R1(TNGTCTTCTGCACNACCTCCGGNG - CCANTC CAASCCYTCWCCDGTSGT). Proses deteksi gen CHS pada daun gambir menghasilkan produk dengan estimasi sebesar 724 bp

Keywords

Chalcone synthase Gambir Katekin PCR

Article Details

License
Isian pada kolom ini dibuat oto matis saat Anda memilih salah satu dari kolom “Copyright Hol der”.
How to Cite
Wardi, E. S., Syukur, S., Chaidir, Z., Jamsari, J., & Sartika, D. (2021). Desain Primer Dan Deteksi Gen CHS (chalcone synthase) Pada Tanaman Gambir (Uncaria gambir (Hunter) Roxb.) Tipe Riau Gadang. RAFFLESIA JOURNAL OF NATURAL AND APPLIED SCIENCES, 1(1), 29–39. https://doi.org/10.33369/rjna.v1i1.15591
Download Citation
Endnote/Zotero/Mendeley (RIS)
BibTeX

References

  1. Amos, Zainudin, I., Triputranto, A., Rusmandana, B., & Ngudiwaluyo, S. Teknologi Pasca Panen Gambir. Badan pengkajian dan Penerapan Teknologi. 2004.
  2. Hamda, F. Identifikasi Karakteristik Gambir (Uncaria spp) di Sumatera Barat dan analisis RAPD. Disertasi. Universitas Padjajaran. Bandung. 2009.
  3. Ferita, I., Jamsari, Suliansyah, I., & Gustian. Studi Hubungan Karakter Morfologi, Anatomi, Dan Molekuler Terkait Potensi Kadar Katekin Pada Tanaman Gambir ( Uncaria gambir (Hunter) Roxb). Journal of Chemical Information and Modeling. 2013.
  4. Dewick, P. M.. Medicinal Natural Products: A Biosynthetic Approach: Third Edition (2nd ed., Vol. 5). 2009. British Library Cataloguing in Publication Data A.
  5. Ferdinal, N., Sulistyo, J., & Nazir, N. Sintesis Enzimatis Flavonoid-glikosida dari Gambir ( Uncaria gambir ) menggunakan Enzim CGT-ase dari Bacillus Licheniformis. Prosiding Semirata FMIPA Universitas Lampung, 2013. 289–296.
  6. Sun, W., Meng, X., Liang, L., Jiang, W., Huang, Y., He, J., Hu, H., Almqvist, J., Gao, X., & Wang, L. Molecular and biochemical analysis of chalcone Synthase from freesia hybrid in flavonoid biosynthetic pathway. PLoS ONE. 2015.
  7. Yu, O., & Jez, J. M. Nature’s assembly line: Biosynthesis of simple phenylpropanoids and polyketides. Plant Journal. 2008.
  8. Widowati, E. W. Desain Primer Sitokrom B (Cyt B) Sebagai Salah Satu Komponen PCR (Polymerase Chain Reaction)Untuk Deteksi DNA Babi. Laporan Penelitian Individual. 2013.
  9. Jamsari. Rekayasa Genetika untuk Analisa Genom dan Produksi Organisme Transgenik. UR Press. 2013.
  10. Maitriani, L. K. B., Wirajana, N., & Yowani, S. C. Desain Primer Untuk Amplifikasi Fragmen Gen Inha Isolat 134 Multidrug Resistance Tuberculosis (MDR-TB) Dengan Metode Polymerase Chain Reaction. 2014
  11. Eskundari, R. D. Isolasi Dan Karakterisasi Fragmen Gen Leafy. institut Pertanian Bogor.
  12. Jamsari. (2007). Bioteknologi Pemula: Prinsip Dasar dan Aplikasi Analisis Molekuler. Universitas Riau Press. 2010
  13. Sambrook, J. F., & Rusell, D. Molecular Cloning: A Laboratory Manual (3-Volume Set). Cold Springs Harbour Press. 2001.
  14. Farrell, R. RNA Methodologies: A Laboratory Guide for Isolation and Characterization (3rd ed). Elsevier Academic Press. 2005
  15. Fadli, M. Isolasi Gen DFR (Dihydroflavonol 4-Reductase) Pada Tanaman gambir (Uncaria gambir (Hunter) Roxb.) Berbasis PCR (Polymerase Chain Reaction) (Issue June). Universitas Andalas Padang. 2016